Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms