Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms