Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF3Q92576 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF3Q92576 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF3Q92576 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF3Q92576 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms