Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms