Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms