Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms