Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRPF8Q6P2Q9 MTHFD1-208ENST00000554739 688 ntTSL 310.82□□□□□ -0.689e-10■■■■■ 28.5
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PRPF8Q6P2Q9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 28.4
PRPF8Q6P2Q9 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 28.4
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PRPF8Q6P2Q9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 28.4
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