Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms