Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms