Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms