Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SAPCD1Q5SSQ6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SAPCD1Q5SSQ6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SAPCD1Q5SSQ6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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SAPCD1Q5SSQ6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAPCD1Q5SSQ6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SAPCD1Q5SSQ6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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SAPCD1Q5SSQ6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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