Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP188Q5SRE5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms