Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSL3PQ5NE16 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms