Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCID2Q5JVF3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms