Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C5orf47Q569G3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms