Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms