Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KHDC1Q4VXA5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms