Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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