Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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