Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms