Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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