Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms