Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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NEDD8Q15843 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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