Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms