Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1AQ15573 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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