Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms