Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 518.42■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 217.31■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 415.36■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 513.24□□□□□ -0.294e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 20.8
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PCBP2Q15366 PPP1R11-202ENST00000376763 1464 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 PPP1R11-203ENST00000376765 1536 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.361e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 20.8
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PCBP2Q15366 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.47e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 INTS4-201ENST00000433818 3459 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.497e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 LARS2-202ENST00000414984 2800 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.73e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.873e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 LARS2-201ENST00000265537 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.893e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 LARS2-206ENST00000467936 804 ntTSL 46.9□□□□□ -1.33e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.74■■□□□ 1.239e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 LRP5-205ENST00000529702 586 ntTSL 310.37□□□□□ -0.753e-9■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 LRP5-204ENST00000529481 551 ntTSL 39.4□□□□□ -0.93e-9■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-210ENST00000533742 720 ntTSL 220.1■□□□□ 0.818e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.658e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-207ENST00000531259 572 ntTSL 515.16■□□□□ 0.028e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.088e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.28e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.488e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-12■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.648e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.74e-12■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 BIRC2-205ENST00000528344 866 ntTSL 57.73□□□□□ -1.178e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 MNAT1-209ENST00000557134 680 ntTSL 35.79□□□□□ -1.484e-12■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 MNAT1-204ENST00000554002 616 ntTSL 33.86□□□□□ -1.794e-12■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.418e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 216.99■□□□□ 0.318e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SIK3-210ENST00000480468 2237 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.768e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SLC9B2-203ENST00000503103 1911 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.838e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SLC9B2-204ENST00000503230 1826 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.948e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SIK3-207ENST00000465421 3459 ntTSL 26.24□□□□□ -1.418e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SLC9B2-211ENST00000515424 793 ntTSL 26.19□□□□□ -1.428e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SIK3-212ENST00000488337 4220 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.498e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SLC9B2-205ENST00000503818 648 ntTSL 44.27□□□□□ -1.738e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.738e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 GDI1-207ENST00000468483 2417 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.428e-10■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 CPSF7-212ENST00000489728 488 ntTSL 410.58□□□□□ -0.722e-8■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 47.15□□□□□ -1.262e-8■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 314.94□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 220.76■□□□□ 0.912e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 520.28■□□□□ 0.842e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 519.94■□□□□ 0.782e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 519.56■□□□□ 0.722e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-212ENST00000579842 715 ntTSL 319.13■□□□□ 0.652e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-208ENST00000579004 341 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-216ENST00000582074 631 ntTSL 310.81□□□□□ -0.682e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-202ENST00000577286 553 ntTSL 210.75□□□□□ -0.692e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 DCXR-203ENST00000577532 573 ntTSL 37.5□□□□□ -1.212e-26■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.562e-8■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 CHD9-201ENST00000219084 8739 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.737e-9■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.821e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.771e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.631e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.271e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SEMA4G-204ENST00000484128 714 ntTSL 210.34□□□□□ -0.754e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.378e-8■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 TMEM109-203ENST00000540280 724 ntTSL 310.31□□□□□ -0.763e-13■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 RAB7A-207ENST00000491681 552 ntTSL 25.17□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SLC38A10-203ENST00000539643 1988 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.442e-8■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-20■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.124e-20■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.364e-20■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 UBE2D3-212ENST00000502563 680 ntTSL 310.26□□□□□ -0.772e-12■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SND1-208ENST00000470463 530 ntTSL 410.83□□□□□ -0.686e-8■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 39.89□□□□□ -0.831e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 CTNND1-209ENST00000524579 505 ntTSL 46.29□□□□□ -1.41e-7■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 TPCN1-219ENST00000552077 3293 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 SYVN1-209ENST00000527765 516 ntTSL 312.03□□□□□ -0.481e-11■■■■□ 20.7
PCBP2Q15366 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)4.95□□□□□ -1.621e-7■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.626e-8■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 UQCC1-216ENST00000473982 551 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-8■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-12■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.041e-7■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 PIKFYVE-206ENST00000443896 3282 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 PIKFYVE-207ENST00000452564 4214 ntTSL 26.08□□□□□ -1.441e-7■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.731e-7■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 SERGEF-216ENST00000531299 440 ntTSL 213.54□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.466e-6■■■■□ 20.6
PCBP2Q15366 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.466e-6■■■■□ 20.6
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