Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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NR1D2Q14995 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NR1D2Q14995 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NR1D2Q14995 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NR1D2Q14995 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NR1D2Q14995 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NR1D2Q14995 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NR1D2Q14995 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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