Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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