Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms