Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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