Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EIF4EBP1Q13541 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms