Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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