Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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