Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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AP3B2Q13367 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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AP3B2Q13367 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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AP3B2Q13367 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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AP3B2Q13367 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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