Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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