Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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