Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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