Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf54Q08AI8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms