Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms