Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms