Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms