Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms