Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPCQ01831 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPCQ01831 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPCQ01831 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPCQ01831 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPCQ01831 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms