Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms