Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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