Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms