Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms