Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP1P63208 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms