Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPL23P62829 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPL23P62829 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms